Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
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TCIRG1Q13488 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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TCIRG1Q13488 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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TCIRG1Q13488 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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TCIRG1Q13488 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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TCIRG1Q13488 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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TCIRG1Q13488 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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TCIRG1Q13488 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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TCIRG1Q13488 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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TCIRG1Q13488 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
TCIRG1Q13488 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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TCIRG1Q13488 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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TCIRG1Q13488 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TCIRG1Q13488 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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