Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 AC017037.4-201ENST00000624526 826 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 GCNT7-202ENST00000617620 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 PQLC2L-206ENST00000468043 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 ZEB2P1-202ENST00000572816 902 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 IFNA16-201ENST00000380216 939 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 AC069213.1-202ENST00000417011 810 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 AC092810.1-201ENST00000429208 1224 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 AC003075.1-206ENST00000448664 541 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 AC018953.1-201ENST00000523265 730 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MKRN4PQ13434 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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