Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MRPL28Q13084 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MRPL28Q13084 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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