Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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TRAF1Q13077 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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TRAF1Q13077 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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TRAF1Q13077 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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TRAF1Q13077 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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TRAF1Q13077 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRAF1Q13077 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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