Protein–RNA interactions for Protein: Q12894

IFRD2, Interferon-related developmental regulator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD2Q12894 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFRD2Q12894 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms