Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIN2AQ12879 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIN2AQ12879 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
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