Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GABPAQ06546 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms