Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNEQ04844 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNEQ04844 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNEQ04844 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNEQ04844 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNEQ04844 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNEQ04844 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNEQ04844 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNEQ04844 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNEQ04844 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNEQ04844 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNEQ04844 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNEQ04844 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNEQ04844 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNEQ04844 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CHRNEQ04844 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNEQ04844 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CHRNEQ04844 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNEQ04844 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNEQ04844 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNEQ04844 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNEQ04844 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNEQ04844 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNEQ04844 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNEQ04844 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNEQ04844 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNEQ04844 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNEQ04844 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNEQ04844 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNEQ04844 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNEQ04844 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNEQ04844 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNEQ04844 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNEQ04844 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNEQ04844 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNEQ04844 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNEQ04844 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNEQ04844 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNEQ04844 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNEQ04844 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNEQ04844 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNEQ04844 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNEQ04844 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNEQ04844 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNEQ04844 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNEQ04844 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNEQ04844 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNEQ04844 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNEQ04844 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNEQ04844 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNEQ04844 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNEQ04844 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CHRNEQ04844 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNEQ04844 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNEQ04844 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNEQ04844 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CHRNEQ04844 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNEQ04844 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CHRNEQ04844 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNEQ04844 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CHRNEQ04844 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNEQ04844 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNEQ04844 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNEQ04844 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CHRNEQ04844 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNEQ04844 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNEQ04844 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNEQ04844 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNEQ04844 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNEQ04844 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNEQ04844 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNEQ04844 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNEQ04844 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNEQ04844 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNEQ04844 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNEQ04844 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNEQ04844 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNEQ04844 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNEQ04844 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNEQ04844 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNEQ04844 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNEQ04844 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNEQ04844 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNEQ04844 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNEQ04844 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNEQ04844 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNEQ04844 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNEQ04844 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNEQ04844 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNEQ04844 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNEQ04844 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNEQ04844 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CHRNEQ04844 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNEQ04844 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNEQ04844 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNEQ04844 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNEQ04844 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CHRNEQ04844 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNEQ04844 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CHRNEQ04844 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms