Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CDR2Q01850 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms