Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDK17Q00537 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.2 ms