Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPM4P67936 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPM4P67936 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPM4P67936 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPM4P67936 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPM4P67936 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPM4P67936 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPM4P67936 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TPM4P67936 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPM4P67936 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPM4P67936 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPM4P67936 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPM4P67936 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPM4P67936 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPM4P67936 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPM4P67936 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPM4P67936 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPM4P67936 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPM4P67936 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPM4P67936 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPM4P67936 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPM4P67936 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPM4P67936 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPM4P67936 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPM4P67936 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPM4P67936 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPM4P67936 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPM4P67936 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPM4P67936 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TPM4P67936 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPM4P67936 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPM4P67936 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPM4P67936 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPM4P67936 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPM4P67936 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPM4P67936 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPM4P67936 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPM4P67936 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPM4P67936 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TPM4P67936 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPM4P67936 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPM4P67936 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPM4P67936 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPM4P67936 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TPM4P67936 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPM4P67936 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPM4P67936 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPM4P67936 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPM4P67936 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPM4P67936 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPM4P67936 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPM4P67936 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPM4P67936 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPM4P67936 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPM4P67936 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPM4P67936 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPM4P67936 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPM4P67936 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPM4P67936 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPM4P67936 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPM4P67936 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPM4P67936 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPM4P67936 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPM4P67936 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPM4P67936 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPM4P67936 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPM4P67936 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPM4P67936 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPM4P67936 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPM4P67936 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPM4P67936 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPM4P67936 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPM4P67936 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPM4P67936 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPM4P67936 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TPM4P67936 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TPM4P67936 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TPM4P67936 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TPM4P67936 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TPM4P67936 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TPM4P67936 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TPM4P67936 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TPM4P67936 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TPM4P67936 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TPM4P67936 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TPM4P67936 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TPM4P67936 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TPM4P67936 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TPM4P67936 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TPM4P67936 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TPM4P67936 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TPM4P67936 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TPM4P67936 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TPM4P67936 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TPM4P67936 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TPM4P67936 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TPM4P67936 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TPM4P67936 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TPM4P67936 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TPM4P67936 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms