Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ERVS71-1P61550 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms