Protein–RNA interactions for Protein: P61073

CXCR4, C-X-C chemokine receptor type 4, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR4P61073 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CXCR4P61073 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CXCR4P61073 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CXCR4P61073 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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