Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAP25P60880 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms