Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX16P57768 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX16P57768 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX16P57768 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX16P57768 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX16P57768 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX16P57768 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX16P57768 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX16P57768 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX16P57768 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX16P57768 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX16P57768 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX16P57768 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX16P57768 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX16P57768 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX16P57768 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX16P57768 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX16P57768 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX16P57768 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX16P57768 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX16P57768 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX16P57768 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX16P57768 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX16P57768 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX16P57768 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX16P57768 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX16P57768 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX16P57768 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX16P57768 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX16P57768 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX16P57768 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX16P57768 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX16P57768 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX16P57768 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX16P57768 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX16P57768 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX16P57768 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX16P57768 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX16P57768 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX16P57768 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX16P57768 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX16P57768 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX16P57768 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX16P57768 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX16P57768 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX16P57768 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX16P57768 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX16P57768 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX16P57768 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX16P57768 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX16P57768 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX16P57768 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX16P57768 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX16P57768 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX16P57768 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX16P57768 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX16P57768 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX16P57768 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX16P57768 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX16P57768 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX16P57768 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX16P57768 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX16P57768 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX16P57768 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX16P57768 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX16P57768 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX16P57768 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX16P57768 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX16P57768 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX16P57768 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX16P57768 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX16P57768 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX16P57768 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX16P57768 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX16P57768 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX16P57768 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX16P57768 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX16P57768 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX16P57768 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX16P57768 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX16P57768 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX16P57768 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX16P57768 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX16P57768 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX16P57768 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX16P57768 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX16P57768 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX16P57768 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX16P57768 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX16P57768 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX16P57768 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX16P57768 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX16P57768 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX16P57768 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX16P57768 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX16P57768 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX16P57768 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX16P57768 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX16P57768 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNX16P57768 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms