Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms