Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

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Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRXP46100 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRXP46100 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRXP46100 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRXP46100 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRXP46100 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRXP46100 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRXP46100 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRXP46100 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRXP46100 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRXP46100 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRXP46100 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRXP46100 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRXP46100 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRXP46100 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRXP46100 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRXP46100 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRXP46100 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRXP46100 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRXP46100 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRXP46100 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRXP46100 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRXP46100 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRXP46100 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRXP46100 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRXP46100 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRXP46100 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRXP46100 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRXP46100 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRXP46100 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRXP46100 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRXP46100 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATRXP46100 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRXP46100 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRXP46100 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRXP46100 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRXP46100 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRXP46100 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRXP46100 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRXP46100 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRXP46100 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRXP46100 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRXP46100 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRXP46100 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRXP46100 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRXP46100 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRXP46100 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRXP46100 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRXP46100 AC084262.1-201ENST00000567818 751 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRXP46100 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRXP46100 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRXP46100 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRXP46100 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRXP46100 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRXP46100 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRXP46100 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRXP46100 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRXP46100 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRXP46100 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRXP46100 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRXP46100 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRXP46100 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRXP46100 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRXP46100 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRXP46100 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRXP46100 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRXP46100 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRXP46100 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRXP46100 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRXP46100 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRXP46100 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRXP46100 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRXP46100 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRXP46100 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRXP46100 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRXP46100 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRXP46100 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRXP46100 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRXP46100 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRXP46100 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRXP46100 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRXP46100 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRXP46100 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRXP46100 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRXP46100 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRXP46100 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRXP46100 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRXP46100 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRXP46100 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRXP46100 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRXP46100 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRXP46100 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRXP46100 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRXP46100 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRXP46100 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRXP46100 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRXP46100 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRXP46100 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRXP46100 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRXP46100 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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