Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GRIA2P42262 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms