Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXC13P31276 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms