Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNGA1P29973 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNGA1P29973 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms