Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA1P25391 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LAMA1P25391 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms