Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
APCP25054 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
APCP25054 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
APCP25054 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
APCP25054 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
APCP25054 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
APCP25054 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
APCP25054 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
APCP25054 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
APCP25054 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
APCP25054 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
APCP25054 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
APCP25054 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
APCP25054 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
APCP25054 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
APCP25054 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
APCP25054 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
APCP25054 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
APCP25054 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
APCP25054 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
APCP25054 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
APCP25054 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
APCP25054 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
APCP25054 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
APCP25054 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
APCP25054 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
APCP25054 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
APCP25054 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
APCP25054 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
APCP25054 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
APCP25054 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
APCP25054 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
APCP25054 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
APCP25054 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
APCP25054 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
APCP25054 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
APCP25054 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
APCP25054 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
APCP25054 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
APCP25054 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
APCP25054 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
APCP25054 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
APCP25054 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
APCP25054 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
APCP25054 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
APCP25054 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
APCP25054 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
APCP25054 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
APCP25054 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
APCP25054 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
APCP25054 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
APCP25054 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
APCP25054 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
APCP25054 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
APCP25054 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
APCP25054 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
APCP25054 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
APCP25054 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
APCP25054 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
APCP25054 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
APCP25054 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
APCP25054 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
APCP25054 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
APCP25054 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
APCP25054 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
APCP25054 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
APCP25054 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
APCP25054 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
APCP25054 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
APCP25054 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
APCP25054 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
APCP25054 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
APCP25054 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
APCP25054 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
APCP25054 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
APCP25054 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
APCP25054 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
APCP25054 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
APCP25054 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
APCP25054 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
APCP25054 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
APCP25054 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
APCP25054 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
APCP25054 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
APCP25054 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
APCP25054 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
APCP25054 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
APCP25054 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
APCP25054 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
APCP25054 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
APCP25054 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
APCP25054 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
APCP25054 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
APCP25054 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
APCP25054 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
APCP25054 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
APCP25054 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
APCP25054 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
APCP25054 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
APCP25054 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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