Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
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CCL3L1P16619 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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CCL3L1P16619 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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