Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSLP07711 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSLP07711 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSLP07711 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSLP07711 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSLP07711 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSLP07711 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSLP07711 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSLP07711 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSLP07711 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSLP07711 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSLP07711 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSLP07711 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSLP07711 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSLP07711 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSLP07711 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSLP07711 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSLP07711 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSLP07711 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSLP07711 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSLP07711 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSLP07711 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSLP07711 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSLP07711 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSLP07711 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSLP07711 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSLP07711 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSLP07711 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSLP07711 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSLP07711 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSLP07711 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSLP07711 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSLP07711 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSLP07711 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSLP07711 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSLP07711 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSLP07711 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSLP07711 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSLP07711 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSLP07711 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSLP07711 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSLP07711 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSLP07711 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTSLP07711 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSLP07711 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSLP07711 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSLP07711 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSLP07711 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSLP07711 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSLP07711 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSLP07711 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSLP07711 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSLP07711 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSLP07711 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSLP07711 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSLP07711 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSLP07711 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSLP07711 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSLP07711 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSLP07711 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSLP07711 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSLP07711 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSLP07711 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSLP07711 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSLP07711 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSLP07711 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSLP07711 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSLP07711 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSLP07711 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSLP07711 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSLP07711 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSLP07711 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSLP07711 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSLP07711 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSLP07711 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSLP07711 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSLP07711 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSLP07711 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSLP07711 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSLP07711 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSLP07711 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSLP07711 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSLP07711 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSLP07711 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSLP07711 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSLP07711 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSLP07711 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSLP07711 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSLP07711 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSLP07711 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSLP07711 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSLP07711 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSLP07711 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSLP07711 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSLP07711 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSLP07711 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSLP07711 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSLP07711 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSLP07711 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSLP07711 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms