Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPFIA3O75145 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms