Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COCHO43405 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
COCHO43405 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COCHO43405 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
COCHO43405 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COCHO43405 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COCHO43405 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COCHO43405 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COCHO43405 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COCHO43405 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COCHO43405 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COCHO43405 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COCHO43405 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COCHO43405 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COCHO43405 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COCHO43405 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COCHO43405 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
COCHO43405 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COCHO43405 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COCHO43405 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COCHO43405 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COCHO43405 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COCHO43405 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COCHO43405 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COCHO43405 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COCHO43405 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COCHO43405 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COCHO43405 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COCHO43405 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COCHO43405 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COCHO43405 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COCHO43405 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COCHO43405 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COCHO43405 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COCHO43405 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COCHO43405 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COCHO43405 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COCHO43405 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
COCHO43405 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COCHO43405 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COCHO43405 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COCHO43405 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COCHO43405 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COCHO43405 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COCHO43405 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COCHO43405 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COCHO43405 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COCHO43405 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
COCHO43405 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
COCHO43405 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COCHO43405 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COCHO43405 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COCHO43405 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COCHO43405 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COCHO43405 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COCHO43405 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COCHO43405 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COCHO43405 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COCHO43405 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COCHO43405 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COCHO43405 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COCHO43405 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COCHO43405 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COCHO43405 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COCHO43405 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COCHO43405 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COCHO43405 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COCHO43405 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COCHO43405 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COCHO43405 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COCHO43405 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COCHO43405 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COCHO43405 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COCHO43405 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COCHO43405 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COCHO43405 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COCHO43405 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COCHO43405 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COCHO43405 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COCHO43405 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COCHO43405 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COCHO43405 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COCHO43405 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COCHO43405 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COCHO43405 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COCHO43405 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COCHO43405 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COCHO43405 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COCHO43405 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COCHO43405 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COCHO43405 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COCHO43405 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COCHO43405 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COCHO43405 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COCHO43405 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COCHO43405 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COCHO43405 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COCHO43405 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COCHO43405 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COCHO43405 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms