Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTSS1O43312 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms