Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PATL2C9JE40 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms