Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.38□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC10.38□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
HECTD4Q9Y4D8 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms