Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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SH3BP1Q9Y3L3 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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SH3BP1Q9Y3L3 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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SH3BP1Q9Y3L3 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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SH3BP1Q9Y3L3 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP1Q9Y3L3 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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