Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SHANK2Q9UPX8 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHANK2Q9UPX8 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms