Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP35Q9P2H5 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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