Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM248Q9NWD8 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms