Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.1 ms