Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms