Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TIMMDC1Q9NPL8 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms