Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE41Q9C0J9 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms