Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIM5Q9C035 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIM5Q9C035 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms