Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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FOXQ1Q9C009 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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FOXQ1Q9C009 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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FOXQ1Q9C009 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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FOXQ1Q9C009 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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FOXQ1Q9C009 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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FOXQ1Q9C009 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXQ1Q9C009 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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