Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYCP2Q9BX26 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYCP2Q9BX26 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms