Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CHCHD7Q9BUK0 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms