Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM79Q9BSE2 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms