Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms