Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms