Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CAPZA3Q96KX2 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms