Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms