Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TM4SF18Q96CE8 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TM4SF18Q96CE8 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms