Protein–RNA interactions for Protein: Q96B67

ARRDC3, Arrestin domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC3Q96B67 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARRDC3Q96B67 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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