Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCAMP4Q969E2 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCAMP4Q969E2 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms