Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRUQ92729 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms